Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm1993A6X8I0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm1993A6X8I0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm1993A6X8I0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm1993A6X8I0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms