Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3173A6NAS3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3173A6NAS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3173A6NAS3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms