Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll2A4Q9E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll2A4Q9E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll2A4Q9E4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms