Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc9bA3KGF9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc9bA3KGF9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms