Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b5A3FIN4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp8b5A3FIN4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp8b5A3FIN4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms