Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl41A2AUC9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl41A2AUC9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klhl41A2AUC9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl41A2AUC9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl41A2AUC9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl41A2AUC9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl41A2AUC9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms