Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rtf1A2AQ19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rtf1A2AQ19 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtf1A2AQ19 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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