Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syndig1A2ANU3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms