Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Frmpd1A2AKB4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Frmpd1A2AKB4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Frmpd1A2AKB4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Frmpd1A2AKB4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Frmpd1A2AKB4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms