Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lcn6A2AJB9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lcn6A2AJB9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lcn6A2AJB9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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