Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pramel3A2AHA7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel3A2AHA7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms