Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc163A2AGD7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc163A2AGD7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms