Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Szt2A2A9C3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Szt2A2A9C3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Szt2A2A9C3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms