Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fam71e1A1L3C1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Fam71e1A1L3C1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fam71e1A1L3C1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms