Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trav12-2A0N8N6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trav12-2A0N8N6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms