Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0U1RNP2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0U1RNP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms