Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms