Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trbv16A0A0B4J1H3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv16A0A0B4J1H3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trbv16A0A0B4J1H3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv16A0A0B4J1H3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv16A0A0B4J1H3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv16A0A0B4J1H3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv16A0A0B4J1H3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv16A0A0B4J1H3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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