Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B607

Trav14-3, T cell receptor alpha variable 14-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-3A0A075B607 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav14-3A0A075B607 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trav14-3A0A075B607 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trav14-3A0A075B607 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms