Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Y3

Ighv1-80, Immunoglobulin heavy variable 1-80 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ighv1-80A0A075B5Y3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ighv1-80A0A075B5Y3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ighv1-80A0A075B5Y3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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