Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Speer3W4VSP1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Speer3W4VSP1 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Speer3W4VSP1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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