Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Krt27Q9Z320 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms