Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Hdac6Q9Z2V5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac6Q9Z2V5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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