Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp5Q9Z2P8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms