Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ilf3Q9Z1X4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms