Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms