Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trpc2Q9R244 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trpc2Q9R244 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms