Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gpc6Q9R087 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms