Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fhl3Q9R059 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms