Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms