Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms