Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmQ9QXG2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms