Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Trappc2lQ9JME7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc2lQ9JME7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms