Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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SrfQ9JM73 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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SrfQ9JM73 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SrfQ9JM73 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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