Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Tmod4Q9JLH8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tmod4Q9JLH8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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