Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trem1Q9JKE2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms