Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp29Q9ES63 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms