Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Stx12Q9ER00 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms