Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Xab2Q9DCD2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms