Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccdc97Q9DBT3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccdc97Q9DBT3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc97Q9DBT3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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