Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Swt1Q9DBQ9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms