Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TrmuQ9DAT5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrmuQ9DAT5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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