Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9DAA3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms