Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms