Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms