Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg7Q9D906 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Atg7Q9D906 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms