Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Q9D8L0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms