Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rep15Q9D7T1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Rep15Q9D7T1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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