Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Capns2Q9D7J7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms