Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Snx29Q9D3S3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Snx29Q9D3S3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx29Q9D3S3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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